 |
Вы находитесь здесь: dace.ru / Новости химии / Раскрыта тайна взаимодействия ДНК-белок
Архивы новостей:
2008 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2009 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2010 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2011 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2012 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2013 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2014 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2015 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2016 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2017 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2018 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2019 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2020 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2021 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2022 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2023 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2024 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2025 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
2026 год:
январь, февраль, март, апрель, май, июнь, июль, август, сентябрь, октябрь, ноябрь, декабрь
Раскрыта тайна взаимодействия ДНК-белок
Впервые исследователям удалось наблюдать за взаимодействием молекул белка с длинноцепочечной молекулой ДНК в режиме реального времени. Предполагается, что результаты нового исследования позволят получить новую информацию об особенностях репликации и репарации ДНК.
Разработавший новый метод наблюдения за биомолекулами Эрик Грин из Университета Колумбия отмечает, что до настоящего времени было возможно наблюдение лишь за взаимодействием белков с весьма небольшими по размерам одноцепочечными участками ДНК или двухцепочечными молекулами, однако в клетке в обменных процессах, в которых принимает участие ДНК, например – репарации, принимает участие лишь одна цепь ДНК.
Для разработки способа слежения за длинными одноцепочечными молекулами ДНК исследователи из группы Грина модифицировали разработанный ими ранее метод, позволяющий визуализировать взаимодействие белков с двухцепочечной ДНК. Этот метод заключался в том, что молекулу ДНК с введенной флуоресцентной меткой связывали с липидами, находящимися в двойном слое, который прикрывал поверхность микрокапиллярной камеры с образцом. При пропускании буферного раствора через камеру молекулы ДНК диффундируют через двойной слой, ориентируясь вдоль наноразмерного барьера в двойном слое. Исследователи добавляли белки к камере и наблюдали их взаимодействие с ДНК в режиме реального времени, следя за изменением флуоресцентного сигнала. Исследователи назвали новый метод «ДНК-занавесь», поскольку сотни регулярно ориентированных ДНК, визуализированных с помощью флуоресцентной микроскопии, напомнил им занавеску для окон.
Однако эта методика шестилетний давности не позволяла работать с одноцепочечной ДНК, которая настолько гибка, что часто самоскручивается, образуя вторичные структуры, пне способные связываться с белками, к тому же флуоресцентные красители, применяющиеся для введения метки в двухцепочечные ДНК, могут способствовать разрушению одноцепочечных ДНК.
Решая эту проблему, Грин с соавторами нашли способ одновременной раскрутки свернутой одноцепочечной ДНК и введения в нее флуоресцентной метки. Ключом для решения проблемы оказался репликативный белок А (RPA), который связывается с одноцепочечными нитями ДНК в ходе репликации ДНК, не позволяя ДНК скручиваться. Когда исследователи добавили белок со введенной флуоресцентной меткой к системе «ДНК-занавесь», белок связывался с одноцепочечными ДНК, что способствовало растяжению ДНК и обеспечивало доступность ДНК для белков. Поскольку белок RPA в клетках связывается со всеми одноцепочечными ДНК, то, что этот белок помешает связыванию с ДНК других белков, маловероятно.
Для проверки того, сможет ли модифицированная система визуализировать взаимодействия одноцепочечной ДНК с другими белками, исследователи ввели флуоресцентно меченный белок Sgs1 в проточную ячейку, содержащую ДНК, связанную с RPA. Белок Sgs1 представляет собой геликазу дрожжей, участвующую в процессе репарации ДНК (восстановления одной из поврежденных цепей ДНК по информации с другой – комплементарной цепи). С помощью флуоресцентной микроскопии, позволяющей наблюдать и за белком RPA и Sgs1, исследователи смогли наблюдать связывания белка Sgs1 с одноцепочечной ДНК в режиме реального времени.
Источник: Anal. Chem., DOI: 10.1021/ac302117z
Источник: http://www.chemport.ru
18.09.2012 23:15 | |
|
